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  1. 保姆级KEGG数据库教程!医学人如何入门KEGG?信号通路分析必学功 …

    Aug 18, 2022 · 1. KEGG PATHWAY 这部分应该就是大家最熟悉的啦,也是KEGG数据库最核心的部分。 它包含了与通路相关的各种信息,我们解螺旋也有相关课程教大家使用,在此就不赘述。 2. KEGG …

  2. KEGG 怎么用? - 知乎

    9. KEGG NETWORK 这部分和上面的KEGG DISEASE比较像,它是KEGG尝试从扰乱的分子网络中获取有关疾病和药物的信息。 这部分主要包含了癌症、内分泌和代谢性疾病、病毒和细菌感染三部分内 …

  3. 为啥目标基因在kegg富集分析时,没有kegg pathway通路,只有kegg …

    在进行KEGG富集分析时,如果发现目标基因只富集到了KEGG BRITE分类而不是经典的KEGG pathway,这可能意味着以下几种情况: 1. 数据特异性: 你的基因集可能富含一些较为新颖或特定 …

  4. GO和KEGG分析怎么筛选自己想要的基因啊? - 知乎

    GO和KEGG分析怎么筛选自己想要的基因啊? 做了干旱胁迫转录组,做了差异基因GO和KEGG分析,我应该怎么筛选和干旱有关的词条啊? 一般显著的p值低于多少啊,我做的分析里面没有标注显著。 …

  5. 单细胞测序中GO、KEGG、GSEA 分析三个高级分析有什么区别? - 知乎

    单细胞测序中GO、KEGG、GSEA分析是三种常用的高级分析方法,它们各有特点和应用场景,以下是它们的主要区别: GO分析 1.定义与目的: Gene Ontology(GO)是一个国际标准化的基因功能分类 …

  6. 请问KEGG特异性通路图怎么看? - 知乎

    请问KEGG特异性通路图怎么看? 刚入行小白提问,一个物种的KEGG特异性通路图,基因标注有白框的和绿框的。 绿框的是一定存在的基因吗? 白框的是一定不存在的基因吗? 这里面有什么门道吗? …

  7. 大佬们,请问KEGG共富集后,有很多通路如何选择关键通路??? - 知乎

    大佬们,请问KEGG共富集后,有很多通路如何选择关键通路? ?? 大佬们,有没有人知道植物组织送样后,数据回来的转录,蛋白,代谢多组学联合分析的KEGG共富集有十多天通路,如何确定关键的 …

  8. kegg气泡图能看出通路是上调还是下调吗? - 知乎

    Nov 5, 2024 · 如题 一般来说,KEGG气泡图本身并不直接显示基因表达水平的变化方向(上调或下调),但它可以帮助你识别出哪些通路可能与你的研究问题相关,并进一步进行深入分析。 …

  9. 关于用r语言绘制GO/KEGG富集分析图? - 知乎

    在“heatmap”csv文件中,有六位病人的基因表达谱,其中OR123与C123分别为耐药组与正常癌症治疗组,我将表格中的所有基因在OR组与C组之间做差异表达排名并储存本地,将排名前25名的基因用R制 …

  10. KEGG富集分析结果,应该看p值还是矫正p值呢? - 知乎

    Feb 18, 2021 · 生信小白,临床大夫,请多包涵~KEGG的结果,大部分p值<0.05,但是矫正p值都>0.05,这样KEGG富集的结果…